近年來農田大量使用化肥和農藥，使土壤中有機質匱乏，微生物種類和數量大大減少，其中包括一些能夠抑制土傳病害的有益微生物，如放線菌、木霉菌、芽孢桿菌等。另外，土壤中缺少腐生菌，植株秸稈不能快速腐爛，病菌有了更多的存活機會，導致枯萎病、根腐病、立枯病等土傳病害逐年加重。

　　實現土壤生態平衡，可抑制土傳病害的發生。需要掌握好兩方面：一是增加土壤中的有機質，可施用農家肥、工廠化生產的有機肥、秸稈還田和種植草木樨等綠肥作物;二是通過施用菌肥增加有益微生物的種類和數量。菌肥中含有大量微生物，可改善作物的營養條件并分解土壤中的有機質，使其轉變成能被植物吸收的養分。注意只有當有機物與有益微生物同時存在時，才能起到增肥防病的效果。

　　目前市場上有多種按適當比例在大量有機物質中植入有益微生物的多效有機肥，其微生物包括能夠分解有機質的酵母菌，能夠分泌植物生長刺激素和抑制病菌的哈茨木霉、綠粘帚霉、放線菌以及?些芽孢桿菌和假單胞菌等，具有長效、速效、增產防病等特點。