當前，無論是棚萊農業產區還是傳統糧棉果種植帶，畜禽廄肥直接施入田地中的現象十分普遍，且不說不法運輸商戶用廢酸燒解和摻假現象，僅糞肥中的鹽量和骨粉（貝殼粉）夾帶的病菌蟲卵也是經營戶和農民朋友應該注意的。

　　開發當地有機肥源利大弊小。雖然近年來國家大力發展有機農業，引導低碳消費，但是由于農村勞動力價值逐年提高，打工經濟不斷發展，遍布鄉村的秸稈（除直接還田外），人畜糞便，生活垃圾不能投入到大田之中，造成鄉村環境問題加重，影響了居民生活。另外還有池塘沉積泥肥，河道草泥肥等都有待開發使用。

　　引進外地有機肥源應注意防假、防劣、防蟲。近年來，一些蔬菜產區（包括冬暖棚、拱棚），因產值效益高，有機肥和化肥投入加大，不少冬棚一次投入每畝10余方，僅此一項投資千元以上，且連年投入。這其中的很多生雞糞是從外地養殖區內購進的，難免在運輸中摻假造劣，并帶來病菌蟲卵。大家知道，在畜禽養殖比較集中的地方，摻混飼料差異很大，尤其是骨粉，不少商家用貝殼粉摻混，其中夾雜著大量蝸牛卵粒，而在飼喂畜禽后產生的糞便中寄生繁殖傳播，其他細菌、真菌、蚊蠅卵也在傳播途中。因此，引進外地有機肥源必須做好以上“四防”，以減少不必要的投入。

　　施用具有一定生產資格和規模的工廠化有機肥。隨著農業科技推廣基礎力量的不斷加強，化肥價格越來越透明，一些農資經營者便引導農民合理使用化肥，增施工廠化有機肥。但是工廠化有機肥優劣混雜，農民真假難辯，加上一批批“忽悠團”助力，嚴重影響著正規生產廠家的有機肥銷售和施用，侵害農民的生產投資利益。近年來國家支持供銷社、農業部門、郵政系統建立了一大批遍布鄉村的農資分銷網絡體系，并配合工商、質檢、安檢、商貿等部門加強監管，利于農民朋友投入有機肥和科學施肥。在深入鄉村推廣使用過程中仍差“一步”，需要政府的大力扶持以及提高農民的科學種植水平。

　　配合使用生物菌肥和殺蟲劑。有機肥的施用需要充分腐熟，并添加適當的有益微生物和殺蟲劑。秸稈肥在腐熟過程中容易產生地下害蟲（蠐蠟、