無土栽培蔬菜的施肥最簡單，只要澆灌營養液就可以。無土栽培營養液的配置要有氮、磷、鉀、鈣、鎂、硫等大量元素和鐵、錳、硼、鋅、銅和鉬等微量元素。營養液的配方有不同植物專用的，也有一些植物通用的， 農藝市場上都可買到，可按照標簽上的說明，合理配制后進行澆灌。 營養液的澆灌是無土栽培的關鍵，標準營養液澆灌的原則是晴天澆，陰雨天不澆;生長前期少澆，結果期多澆。營養液可回收，循環使用，一般每隔20天左右徹底更換1次營養液。
土壤栽培可選用傳統肥料，也可使用營養液。若用傳統肥料，最好選用有機肥，包括植物性肥料和動物糞肥等，盡可能不用化學肥料，因化肥會殘留酸根或鹽根，盆土會變成酸性或堿性，妨礙植物的生長。 農藝市場上有各種專用有機肥料，可根據蔬菜種類選擇合適的有機肥。
利用廚余自制有機堆肥
如果喜歡DIY，還可利用廚余自制有機堆肥，不但減少垃圾量，充分廢物利用，經濟又環保。自制有機肥堆肥的方法非常簡單：先將栽植容器底層撲上碎瓦片或窗紗等進行墊盆，然后覆土約2cm，再將瀝干的廚余放在容器中(約3cm)再覆上一層厚土(約6-9cm)，堆肥就做成了，在這個容器中就可進行播種栽種了。
施肥小竅門
1.如果蔬菜需要移苗，等到移苗后再澆灌營養液。
2.如果蔬菜采用直接播種的方法，不需移苗，那么先澆自來水，保持土壤濕潤，種子發芽、種苗長出后，才能使用營養液。
3.雖然各種植物對水分的要求不同，但基本上每天澆灌一次營養液是比較適當的。如果是葉菜，可以一天澆兩次營養液。
4.生長前期少澆營養液，結果期多澆。桃花零零妖
5.建議每周至少一次只用自來水徹底濾洗栽植容器，除去容器中累積的未用肥料。具體方法是給容器澆足量的水，底部形成自流排水。這個措施能防止有害物質在培養基質中的積聚。
6.有時候，可用添加了微量元素的營養液澆灌蔬菜�？梢赃x擇含有鐵、鋅、硼和錳的水溶性的肥料，按照標簽上的說明進行操作。
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