有機肥作為基肥，可鋪在苗床上，局部改良土壤;也可將有機肥撒到地表，在播種前隨著翻地將肥料全面施入土壤表層，然后耕入土中。施用原則如下：

　　第一，條施、穴施、集中施用，特別是生物有機肥和功能性有機肥。從肥效上看，集中施用對發揮磷素養分的肥料最為有效。如果直接把磷素養分施入土壤，有機肥料中速效態磷成分易被土壤固定，因而肥效降低。溝施、穴施的關鍵是把養分施在根系能夠伸展的范圍內。最理想的施肥方法是，肥料不要接觸種子或作物的根，距離根系有一定距離，作物生長到一定程度后才能吸收利用。

　　第二，液體有機肥，含有大量速效養分，隨灌溉施用，作追肥。有些腐熟好的有機肥料也可作追肥施用。作追肥應注意以下三點：其一，有機肥中大量緩效養分釋放需要一個過程，所以有機肥料做追肥時，應比化肥追肥提前幾天。其二，有機肥料養分含量低，當有機肥料中缺乏某些成分時，可施用適當的單一化肥加以補充。其三，制定合理的基肥、追肥分配比例，高溫栽培作物最好減少基肥施用量，增加追肥施用量。

　　第三，有機肥的養分供應原則是，要滿足有機肥提供的氮素與化肥提供的氮素比例=1∶1的要求。

　　第四，不同質地土壤中有機肥料養分釋放轉化性能和土壤保肥性能不同，應采用不同的施肥方案。砂土應增施有機肥料，提高土壤有機質含量，可改善土壤的理化性狀，增強保肥保水性能。但對于養分含量高的優質有機肥料，一次使用量不能太多，使用過量容易燒苗，轉化的速效養分容易流失，養分含量高的優質有機肥料可分底肥和追肥多次使用。粘土地施用的有機肥料必須充分腐熟，粘土養分供應慢，有機肥料應早施，可接近作物根部。