在農作物施肥過程中，有些農戶偏施化肥，往往導致土壤板結。而單施有機肥，雖有利于培肥地力，但肥效遲緩。如果有機肥與化肥搭配使用，就會起到很好的作用。
全面供應所需養分 化肥養分含量高，肥效快，但持續時間短，養分單一，有機肥正好相反，有機肥與化肥混用可滿足作物各個生長期對養分的需要。
減少養分被固定 化肥施入土壤后，有些養分被土壤吸收或固定，降低了養分的有效性。而與有機肥混施后，可以減少化肥與土壤的接觸面，提高養分的有效性。
改善作物養分吸收 化肥溶解度大，施用后造成較高的滲透壓，影響作物對養分的吸收。如與有機肥搭配混用，就能克服這個弊端。
有效調節土壤酸堿度 堿性土壤單一施酸性化肥，會導致酸性增強，土壤板結加劇。如與有機肥搭配混用，能提高土壤的緩沖能力，有效地調節酸堿度。
增加土壤養分 有機肥是微生物生存的能源，化肥是供給微生物生長發育的無機營養。兩者混用能促進微生物的活力，進而促進有機肥的分解。土壤微生物的活動還能產生維生素、生物素、煙堿酸等，增加土壤養分，提高土壤活力，促進作物健壯生長。
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