生物有機肥料是一種營養十分豐富的肥料，在我國農業發揮中發揮著難以替代的作用。據研究生物有機肥產生明顯作用的關鍵因素是“活的+具有特殊功能的+微生物菌種”，生物有機肥是我國新型肥料中技術含量最高的產品之一，近來以其特有的促進生長、防病抗病效果得到認可，因其技術太強，一般肥料“行政監管部門”檢測技術跟不上，導致市場冒名頂替，農民分不清，南京農業大學資環學院克服土壤連作障礙研究團隊12名正副教授、70余名在讀碩士博士長期從事防控西瓜、黃瓜、番茄、辣椒、茄子和山藥等經濟作物土傳病害生物有機肥的研究，根據經驗設計一套辨別方法供參照。 看物料，是否均勻？
1.產品含水量太高或太低均不利于菌種存活，判斷方法：抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產品。
2.適合特殊功能菌種生長的“有機肥營養”應是套餐型，由多種有機營養物質組成(如：菜粕、黃豆粉等發酵制成)，在光線下能看到原料的痕跡，或者能聞到原料的特殊氣味。
看效果，是否高效？
試驗方法：加少量水將生物有機肥料調成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，第二天拿出來溶化，反復三次，肥料中的菌種將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯好肥料，差異不明顯，表明該產品有問題，建議放棄使用。
看包裝，是否規范？
1.產品登記證：具有農業部微生物肥料登記證證號(注：省級部門無登記權)，正確方法：“微生物肥(登記年)臨字(編號)號”或“微生物肥(登記年)準字(編號)號”；
2.產品技術指標：有效活菌數(CFU)≥0.2億/克，登記時農業部只允許標注≥0.2個億/克、0.5個億/克(嚴格規定，在保存期的最后一天必須要達到這個數值)。一些企業為了迎合市場，刻意標成幾十個億，這是不科學的(目前的技術很難達到)、是錯誤的。
3.產品有效期：國家規定大于6個月。隨著生物有機肥料產品的保存時間延長，有效活菌數會不斷下降，把有效期標注太長都是不負責任的。
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