化肥的利用率很低，只有30%-45%，也就是說，當施入100斤化肥時，實際利用的只有30-45斤。損失的化肥一部分分解釋放到大氣中，一部分則隨著水土流失掉了，還有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收利用。當施入有機肥后，由于有益生物活動改善了土壤結構，增加了土壤保水保肥能力，從而減少了養分的流失。與此同時，有益微生物的解磷解鉀作用，使實際利用的營養元素大大增加。所以施用有機肥，能使化肥的利用率提高到50%以上。