據農業部調查結果，華中和西南地區設施番茄多為中小拱棚，華北等北方地區多為日光溫室，存在的主要施肥問題如下：

　�。�1）過量施肥現象普遍，氮磷化肥用量偏高，土壤氮磷養分積累明顯。（2）養分投入比例不合理，非石灰性土壤鈣、鎂、硼等元素供應存在障礙。（3）過量灌溉導致養分損失嚴重。（4）連作障礙等導致土壤質量退化嚴重，養分吸收效率下降，蔬菜品質下降。

　　施肥原則�。�1）合理施用有機肥，調減氮磷化肥數量，增施鉀肥，非石灰性土壤及酸性土壤需補充鈣鎂硼等中微量元素。（2）根據作物產量、茬口及土壤肥力條件合理分配化肥，大部分磷肥基施、氮鉀肥追施。早春生長前期不宜頻繁追肥，重視花后和中后期追肥。（3）與高產栽培技術結合，采用“少量多次”的原則，合理灌溉施肥。（4）土壤退化的老棚需進行秸稈還田或施用高碳氮比的有機肥，少施禽糞肥，增加輪作次數，達到除鹽和減輕連作障礙目的。

　　施肥量及比例　苗肥增施腐熟有機肥，補施磷肥，每10平方米苗床施經過腐熟的禽糞60～100公斤，鈣鎂磷肥0.5～1公斤，硫酸鉀0.5公斤根據苗情噴施0.5%～0.1%尿素溶液1～2次。

　　基肥施用優質有機肥2～3方/畝。

　　畝產量水平4000～6000公斤，氮肥每畝15～20公斤，磷肥8～10公斤，鉀肥20～25公斤。畝產量水平6000～8000公斤，氮肥每畝 20～30公斤，磷肥10～15公斤，鉀肥30～35公斤。畝產量水平8000～10000公斤，氮肥每畝30～38公斤，磷肥15～20公斤，鉀肥 35～40公斤。70%以上的磷肥作基肥條（穴）施，其余隨復合肥追施 20%～30%氮鉀肥基施，70%～80%在花后至果穗膨大期間分3～10次隨水追施，每次畝追氮肥不超過5～7公斤。

　　菜田土壤pH<6時易出現鈣、鎂、硼缺乏，可每畝基施鈣肥50～75公斤、鎂肥4～6公斤/畝，根外補施2～3次0.1%濃度的硼肥。